作為我國醫(yī)藥制造業(yè)的核心區(qū)域之一，近年來，長三角地區(qū)充分利用區(qū)域醫(yī)藥生產(chǎn)門類齊全的優(yōu)勢，打造集研發(fā)、生產(chǎn)、銷售及信息服務為一體的產(chǎn)業(yè)鏈，形成一批自主創(chuàng)新能力較強、具備一定國際競爭力的醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)密集區(qū)。目前，長三角地區(qū)已經(jīng)形成了較為完整的醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)鏈，在研發(fā)與產(chǎn)業(yè)化、外包服務、國際交流等方面具有較大優(yōu)勢，規(guī)模效應和產(chǎn)業(yè)競爭力在全國名列前茅。國家統(tǒng)計局數(shù)據(jù)顯示，2014年，長三角地區(qū)醫(yī)藥制造企業(yè)達1,308家，占全國的比重為19.2%；實現(xiàn)主營業(yè)務收入4,781.0億元，占全國的比重為20.5%；實現(xiàn)利潤總額632.8億元，占全國的比重為22.9%。

與此同時，長三角地區(qū)醫(yī)藥企業(yè)根據(jù)其所處的不同價值鏈環(huán)節(jié)，在空間分布上已經(jīng)開始出現(xiàn)專業(yè)化分工的特征：上海市專注于以專利藥為目標或需要最新技術的藥物研發(fā)和生產(chǎn)領域，江蘇省和浙江省則更注重常規(guī)醫(yī)藥產(chǎn)品的生產(chǎn)。

上海市具有得天獨厚的研發(fā)優(yōu)勢。首先，上海市科研基礎比較雄厚，擁有長三角數(shù)量最多、水平最高的醫(yī)藥科研機構，為醫(yī)藥研發(fā)提供了強大的技術支持；其次，上海市擁有豐富的醫(yī)院資源，成立了大量針對國內外醫(yī)藥企業(yè)進行藥物臨床研究CRO（合同研究組織）企業(yè)；再次，各類研究所和醫(yī)藥高校的聚集為上海市培養(yǎng)大批專業(yè)人才，并通過其獨特的區(qū)位優(yōu)勢吸引其他地區(qū)的專業(yè)人才；第四，上海市通過設立醫(yī)藥投資基金和專業(yè)投資公司，建立面向國內外的融資平臺，并建設與之相對應的工程技術中心、GMP中試基地、GCP臨床試驗基地，解決產(chǎn)業(yè)化過程中所遇到的技術和資金的瓶頸；最后，輝瑞、強生、葛蘭素史克、阿斯利康、禮來、羅氏等世界500強制藥企業(yè)將研發(fā)中心設于上海市，進一步增強其研發(fā)實力。

江蘇省和浙江省產(chǎn)業(yè)基礎雄厚。江蘇省和浙江省是我國醫(yī)藥制造業(yè)產(chǎn)值較高的省份，醫(yī)藥骨干企業(yè)實力較強，有30余家企業(yè)進入全國制藥工業(yè)百強行列。相對于上海市，這兩個省份在研發(fā)水平和人才資源上并不占優(yōu)勢，位于這兩省的醫(yī)藥企業(yè)主要是應用已經(jīng)成熟的技術進行大規(guī)模的生產(chǎn)活動，以高產(chǎn)量和市場占有率來獲取利潤。浙江省以化學藥品原藥制造為主營，臺州、東港、溫嶺等地是全國化學藥品原藥的生產(chǎn)基地，為長三角及全國化學藥品制劑提供原料基礎。作為醫(yī)藥制造傳統(tǒng)大省和醫(yī)療器械領軍區(qū)域，江蘇省主要生產(chǎn)基地分布在蘇州、常州及連云港，拳頭產(chǎn)品包括心臟支架、骨科器材以及體外檢查設備等。此外，由于毗鄰上海，江蘇、浙江兩省可接受到具備創(chuàng)新能力、經(jīng)驗豐富、技術一流的復合型人才，在一定程度上彌補兩省在人才資源方面的欠缺。

浙江省醫(yī)藥制造業(yè)在全國有舉足輕重的地位，是我國最重要的化學藥品原藥和醫(yī)藥中間體生產(chǎn)基地之一。     

根據(jù)《長江三角洲地區(qū)區(qū)域規(guī)劃》，今后，長三角地區(qū)將建成上海生物及新型醫(yī)藥研發(fā)與生產(chǎn)中心，加快建設上海、泰州、杭州國家生物產(chǎn)業(yè)基地，進一步做強無錫“太湖藥谷”等品牌，建設南京、蘇州、連云港、杭州、湖州、金華等中醫(yī)藥、化學藥品原藥和生物醫(yī)藥研發(fā)生產(chǎn)基地，加快以上海臨港新城、鹽城、寧波、舟山等為重點的海洋生物產(chǎn)業(yè)發(fā)展。