珠三角地區醫藥流通體系發達，毗鄰港澳地區，對外輻射能力較強，民營資本比較活躍，圍繞廣州、深圳等重點城市形成了商業網絡發達的醫藥產業集群。國家統計局數據顯示，2014年，珠三角地區醫藥制造企業達375家，占全國的比重為5.5%；實現主營業務收入1,290.4億元，占全國的比重為5.5%；實現利潤總額143.1億元，占全國的比重為6.2%。

　　廣州市創新驅動發展。目前，廣州市醫藥產業集群已經形成了“兩中心多區域”的布局，即以廣州科學城為核心的產業孵化中心，以廣州國際生物島為核心的產業創新中心，以白云生物醫藥園區、番禺生物醫藥基地和從化生物醫藥基地等各區（縣級市）特色產業園區為輻射區域的產業布局，擁有較完善的技術研發和中試、產品制造和技術服務的產業鏈。此外，廣州市還擁有完整的醫藥產業產學研技術創新體系，形成了由10多所高等院校、40多家研究院所、70多個省級以上重點學科、5個國家重點實驗室、7個國家工程技術研究中心（工程實驗室）和400多家研發型企業組成的生物醫藥技術創新網絡，工程化研究和產業化能力日益突出，是中國重要的醫藥創新源頭之一。

　　深圳市研發體系發展較快。深圳市以創新藥物研發和產業化、藥品制劑出口和醫藥研發外包體系為核心的產業體系發展較快，技術研發優勢突出：依托華大基因研究院組建了中國首個、全球第四個國家基因庫，還建設了中國科學院生物醫學信息與健康工程學重點實驗室、北京大學深圳研究生院化學基因組學國家重點實驗室等眾多研發平臺。隨著生物醫藥產業被列為深圳市“十二五”重點發展的三大新興產業之一，深圳作為我國南方醫藥產業核心城市的地位將進一步穩固。今后，深圳市有望成為我國醫藥制造業新的增長極。目前，深圳市醫藥研發水平與上海、北京兩大研發中心差距較大，尤其是高端人才比較缺乏。但是，隨著中國國家基因庫的建立，深圳市生命科學研究及生物信息安全領域研發水平將得到極大地提高，并將成為中國基因技術、生命信息科學專項領域的研發中心。到“十二五”末期，深圳市將成為世界領先的基因治療藥物研發與產業化基地，亞洲最大的疫苗生產中心、中國領先的創新藥物研發與產業化和藥品制劑出口基地。